معلومة

تحليل الحمض النووي (AncestryDNA)


حديثا1 يسلط إعلان AncestryDNA التجاري الضوء على الزبون الذي اكتشف أنه 26٪ من الأمريكيين الأصليين.

الائتمان: ancestry.com/dna

يمكنك مشاهدة الإعلان الكامل هنا.

سؤالي هو كيف يكون هذا؟

ما هي مجموعة النسب العرقي للوالدين التي تملي أن الشخص هو 26٪ أمريكي أصلي (أو أي عرق آخر في هذا الشأن) ، وكم عدد الأجيال السابقة التي يجب أن يذهب المرء لتحقيق هذه الأرقام؟


1. مؤخرًا بالنسبة لي ، لا أشاهد التلفزيون كثيرًا.


هذه الاختبارات لا تخبر أسلافك في الواقع ، لا توجد طريقة للاختبار الجيني للقيام بذلك لأن هناك الكثير من التباين الجيني بين السكان ، وكذلك بين المجموعات.

بدلاً من ذلك ، يقوم الاختبار بالإبلاغ ، بناءً على تعدد الأشكال الملحوظ ، و تقدير أسلافهم على أساس مشاركة تلك الأشكال المتعددة مع آخرين من مجموعة. كيف تعرف ما هي تعدد الأشكال لدى الأمريكيين الآسيويين أو الأصليين؟ حسنًا ، تقوم بإجراء اختبارات على مجموعة من الآسيويين ومجموعة من الأمريكيين الأصليين وتستخدم أوجه التشابه بينهم مقارنة بالمجموعات الأخرى لتشكيل "ملف تعريف" لتلك المجموعة. ومع ذلك ، حتى الفرد الذي يتمتع بنسب جغرافي مثالي يمكنه مشاركة تعدد الأشكال مع المجموعات العرقية الأخرى.

تحتوي ويكيبيديا على قسم حول هذا:

تقدم العديد من الشركات توزيعًا نسبيًا حسب العرق أو المنطقة. بشكل عام ، يتم تحديد العالم في حوالي 20-25 منطقة ، ويتم تحديد النسبة المئوية التقريبية للحمض النووي الموروث من كل منطقة. يتم ذلك عادة عن طريق مقارنة تواتر كل علامة DNA جسمية تم اختبارها مع العديد من المجموعات السكانية. تعتمد موثوقية هذا النوع من الاختبار على حجم السكان المقارن ، وعدد العلامات التي تم اختبارها ، والقيمة المعلوماتية للأصل لـ SNPs التي تم اختبارها ، ودرجة الاختلاط في الشخص الذي تم اختباره. غالبًا ما كانت التقديرات السابقة للعرق غير دقيقة إلى حد كبير ، لكن دقتها تحسنت بشكل كبير منذ ذلك الحين. عادةً ما تكون النتائج على المستوى القاري دقيقة ، ولكن قد تكون التأكيدات الأكثر تحديدًا للاختبار غير صحيحة. على سبيل المثال ، غالبًا ما يتلقى الأوروبيون نسبة مبالغ فيها من الإسكندنافيين. غالبًا ما تقوم شركات الاختبار بتحديث تقديراتها العرقية بانتظام ، وتغيير تقدير العرق للفرد.

باختصار: اختبار العرق هو في أفضل الأحوال لإرضاء الفضول. لا توجد طريقة تمكن الاختبارات الجينية من تحديد علم الجينات الخاص بك تمامًا ، وفي الواقع لا معنى للقيام بذلك ، لأن التزاوج بين المجموعات السكانية المتميزة جغرافيًا يحدث طوال الوقت.


أفضل اختبار للحمض النووي لعام 2021: AncestryDNA مقابل 23andMe وأكثر

هل تبحث عن أفضل مجموعة اختبار الحمض النووي وأفضل خدمات الاختبار؟ هذه هي أفضل الخيارات الخاصة بك.

مدفوعة بزيادة الوضوح وانخفاض الأسعار وتحسين العلم ، دخل اختبار الحمض النووي إلى التيار الرئيسي على مدار العشرين عامًا الماضية. يمكن أن يساعدك اختبار الحمض النووي في التعرف على الأقارب المقربين على طول طريق العودة إلى أسلافك الأوائل ، والذي يمكن أن يبدأ أو يعزز فهمك لتاريخ عائلتك. على الرغم من كونه موضوعًا مثيرًا للجدل وشائكًا ، إلا أن بعض الاختبارات تدعي أنها تكشف عن "عرقك" ، ويمكن لبعض الخدمات أن تلقي الضوء على استعدادك الوراثي للأمراض والسمات الفسيولوجية التي تتراوح من لون العين إلى تحملك للكزبرة.

مرة أخرى في الفترات ، يكلف اختبار الحمض النووي `` افعل ذلك بنفسك '' حوالي 1000 دولار. الآن ، يقدم رواد مثل 23andMe و Ancestry والناشئون بما في ذلك DNA الحي تحليلًا متطورًا للتركيب الجيني الخاص بك لجزء بسيط من ذلك.

هناك ثلاثة أنواع من اختبارات الحمض النووي - لكل منها نقاط القوة والقيود والأسباب المنطقية الخاصة به.

  • ان اختبار الحمض النووي هو أفضل استثمار لمعظم المبتدئين حيث يمكنه تحديد الأقارب الذين تتراوح أعمارهم بين خمسة وسبعة أجيال ، عبر خطوط الأم والأب.
  • يمكن للرجال فقط استخدام أ اختبار Y-DNA، والذي يحدد الأقارب الذكور على خط الأب الذي يعود تاريخه إلى 60.000 عام إذا كنت تبحث عن تتبع تاريخ اسم العائلة لعائلتك ، فهذا هو الاختبار الذي يجب استخدامه.
  • و اختبار الحمض النووي للميتوكوندريا، المعروف أيضًا باسم اختبار mtDNA، يمكن أن تحدد العلاقات الجينية على خط الأم منذ ما يصل إلى 150000 سنة مضت ، يمكن لكل من الرجال والنساء إجراء هذا النوع من الاختبارات.

بعد ذلك ، ستقدم لك كل شركة اختبار تحليلاً لنتائج اختبار الحمض النووي الخاص بك. يمكن أن تشمل هذه النتائج منشأك الجغرافي - يدعي البعض أنه قادر على تحديد بلد أو بلدة أو حتى "قبيلة" معينة - تركيبة سلالتك الجينية وما إذا كنت عرضة لمرض وراثي معين. يجب أن نلاحظ على الرغم من أن هذه الاختبارات لا تخدم غرضًا تشخيصيًا - فالاختبار الجيني الذي يديره الطبيب والمتابعة مع مستشار الجينات أمر ضروري إذا كنت تعتقد أنك مصاب بمرض وراثي. لا يمكن لأي شركة اختبار عبر الإنترنت تقدم نتائج من عينة من اللعاب أن تحل محل الاختبار الصحي الذي أجراه طبيبك.

ستقدم بعض الشركات أيضًا "مطابقات" من قواعد بيانات الحمض النووي الخاصة بها ، والتي ستمنحك السبق في التواصل مع الأقارب المحتملين ، وتقدم درجة معينة من دعم أبحاث شجرة العائلة. تقدم AncestryDNA ، على سبيل المثال ، خدمة اشتراك تتضمن الوصول إلى مئات من قواعد البيانات التي تحتوي على إعلانات الولادة والوفاة والزواج ووثائق التعداد وأرشيف الصحف والسجلات التاريخية الأخرى.

تبيع بعض شركات الحمض النووي الاختبارات المصممة لأعراق معينة أو مجموعات متخصصة تدعي أنها تلقي الضوء على نظام العناية بالبشرة الأمثل أو الوزن ، وتقدم شركات أخرى اختبارات مصممة لتحديد التركيب الجيني لقطتك أو كلبك (نعم ، يمكنك الحصول على اختبار الحمض النووي للكلاب) . كان الخبراء الذين تحدثت معهم يشككون في فعالية وقيمة هذه الاختبارات ، ومع ذلك ، أوصوا بتجنبها.

إذا اشتركت في نشرة إخبارية واحدة فقط من CNET ، فهذه هي. احصل على أفضل اختيارات المحررين من المراجعات والأخبار ومقاطع الفيديو الأكثر إثارة للاهتمام في اليوم.

على الرغم من عدم وجود دم في اختبار الحمض النووي الحديث - إما أن تمسح الجزء الداخلي من خدك أو تملأ أنبوب اختبار صغير باللعاب - فهناك الكثير من الأسباب التي تجعلك تشعر بالقلق من الشركات التي تبيع هذه الأدوات. يعتمد نجاحك في علم الأنساب في اختبار الحمض النووي إلى حد كبير على توفير معلومات شخصية للغاية عن نفسك وأقاربك - من بياناتك الجينية إلى اسم والدتك قبل الزواج ، وهو حجر الزاوية التقليدي لأمان كلمة المرور.

المخاوف بشأن خصوصية البيانات وأمنها لها ما يبررها ، ويحذر الخبراء من أن التنظيم - خاصة في الولايات المتحدة - يتخلف كثيرًا عن التكنولوجيا. ويجب أن تعلم أن بعض شركات اختبار الحمض النووي قد تشارك البيانات مع شركات الأدوية ووكالات إنفاذ القانون. الحد الأدنى: فكر بشكل نقدي قبل التطوع للحصول على معلومات حول تاريخك الصحي وعلاقاتك العائلية بأي شركة أو منظمة لاختبار الحمض النووي.

يتضمن اختبار الحمض النووي وعلم الأنساب على نطاق أوسع مزيجًا معقدًا من علم الوراثة والاحتمالات والتخمين. تستخدم خدمات اختبار الحمض النووي المختلفة مختبرات وخوارزميات ومعدات ومعايير مختلفة لتحليل المواد الجينية الخاصة بك ، على الرغم من أنه يجب أن تتوقع درجة معينة من التداخل بين التحليلات من شركات مختلفة ، فقد تختلف اختلافًا كبيرًا. هناك أيضًا عنصر الكتلة الحرجة - فكلما كبرت قاعدة بيانات الشركة ، زادت العينة التي يستخدمونها لتحليل نتائجك ، وكلما كانت نتيجة الاختبار الخاصة بك أكثر دقة.

لقد جربنا بعضًا من أفضل خدمات اختبار الحمض النووي ، وتقييم اتساع وعمق عروضها ومنهجياتها وسمعتها وسعرها. ألق نظرة على توصياتنا أدناه. وإذا كنت قد أجريت أيًا من اختبارات الحمض النووي هذه ، فأخبرني عن تجربتك معها في التعليقات أدناه.

هل تبحث عن مزيد من المعلومات المتعمقة حول خدمات اختبار الحمض النووي بشكل عام؟ انتقل إلى شرح مجموعة أدوات اختبار الحمض النووي.


ترشيح تطابقات الحمض النووي في AncestryDNA مع Timber

عندما يقوم شخص ما بإجراء اختبار AncestryDNA ، نقارن الحمض النووي الخاص به بالحمض النووي لمئات الآلاف من المتقدمين للاختبار في قاعدة بيانات AncestryDNA. نحن نبحث عن "تطابق الحمض النووي" & # 8212 الأشخاص الذين يتشاركون الحمض النووي مع بعضهم البعض ، وبالتالي قد يكونون من الأقارب.

الفكرة الرئيسية وراء تحديد تطابق الحمض النووي هي البحث عن قطع الحمض النووي التي يمتلكها شخصان لأن كل منهما ورثها من سلف مشترك حديث. في منشور مدونة سابق حول تحديث العام الماضي لمطابقة الحمض النووي ، قمنا بالتفصيل بالخطوات التي نتخذها لتحويل البيانات الجينية للفرد ، وتلك الخاصة بالآخرين في قاعدة بيانات AncestryDNA ، إلى مطابقات الحمض النووي المقترحة هذه.

تتمثل إحدى هذه الخطوات في تحديد أجزاء أو أجزاء من الحمض النووي من المحتمل أن تكون متطابقة بين أزواج من الأشخاص. ولكن إذا كان لدى شخصين حمض نووي متطابق ، فهذا لا يعني بالضرورة أنهما ورثاها من سلف مشترك حديثًا. يمكن أن تكون قطع الحمض النووي متطابقة بين شخصين لأنهما ينتميان إلى نفس العرق أو السكان & # 8212 مما يعني أنهما (والعديد من نفس المجموعة السكانية) يتشاركون في الحمض النووي الذي ورثوه من سلف بعيد عاش منذ فترة أطول.

لذلك من أجل العثور على مطابقات الحمض النووي التي ترجع إلى حديث أسلافنا ، نحتاج إلى خطوة ترشيح. في AncestryDNA ، نستخدم خوارزمية طورها فريق علمي يسمى الأخشاب. فكرتها الأساسية هي أنه إذا ظهر أن هناك شخصين يمتلكان DNA متطابقًا في مكان معين في الجينوم ، ولكن يبدو أنهما يمتلكان أيضًا حمضًا نوويًا متطابقًا مع آلاف الأشخاص الآخرين في ذلك المكان المحدد ، فمن المحتمل أن يكون الحمض النووي المشترك بين الشخصين موروثًا. من اكثر بعيد سلف (أو مجموعة أسلاف بعيدة). بمعنى آخر ، ربما لا يكون هذا الجزء مناسبًا لسلف مشترك خلال آخر 6 أو 10 أجيال.

لذلك في مثل هذه الحالات ، الأخشاب قد تقوم بتصفية تلك الأجزاء المتطابقة من الحمض النووي تمامًا - ولا تأخذها في الاعتبار عند تقرير ما إذا كان هناك شخصان مرتبطان أم لا. بالنظر إلى نتائج أكثر من 300000 شخص ، وجدنا ذلك أثناء الأخشاب يقوم بتصفية غالبية الأجزاء الصغيرة المتطابقة (& lt 8 سم) ، وغالبًا ما يتم تصفية الأجزاء الأكبر حجمًا (حتى تلك التي يزيد حجمها عن 15 سم). انظر الرسم البياني أدناه.

بعد العثور على ما يبدو أنه أجزاء متطابقة من الحمض النووي بين أزواج من الناس ، سيقوم Timber بتصفية تلك التي لا يبدو أنها موروثة من سلف مشترك حديث. بالنسبة للأجزاء المتطابقة من الأحجام المحددة ، تُظهر الأشرطة النسبة التي تمت تصفيتها بواسطة Timber في مجموعة تضم أكثر من 300000 فرد. (ملاحظة: CentiMorgans (سم) هي وحدة المسافة في الجينوم البشري.)

ما يُظهره هذا الرسم البياني بوضوح هو أنه عند محاولة تحديد مطابقات الحمض النووي الذين يتشاركون في الحمض النووي من سلف مشترك حديث ، فإن هناك ما هو أكثر بكثير من ذلك. الأحجام من قطع الحمض النووي المتطابقة. لا تُثبت الأجزاء المتطابقة الأطول بالضرورة أن هناك سلفًا مشتركًا بين شخصين مؤخرًا. أظهرت مطابقة الحمض النووي بين مئات الآلاف من الأشخاص أنه حتى الأجزاء المتطابقة الطويلة يمكن أن تشير إلى أصل مشترك أو تاريخ سكاني مشترك أو سلف مشترك بعيد.

والخبر السار هو أنه باستخدام مرشح مثل الأخشاب، يمكننا أن نجد الحمض النووي المشترك الذي من المرجح أن يكون بسبب أسلاف مشتركين حديثًا. من المهم أن تضع في اعتبارك أن تحديد شرائح متطابقة وتصفيتها هما قراران إحصائيان ، لذلك من الصعب بناء استنتاجات على أي جزء معين مشترك من الحمض النووي وحده. ولكن إجمالاً ، أظهر عدد كبير من التجارب على البيانات من العائلات الحقيقية وكذلك تلك التي تم هندستها حسابياً أن الأخشاب قوي بشكل استثنائي في إزالة تطابقات الحمض النووي التي ترجع إلى العلاقات البعيدة.

حيث الأخشاب مدعوم بنتائج مطابقة الحمض النووي بين مئات الآلاف من الأشخاص ، الأخشاب هو عامل تصفية مخصص ممكن بشكل فريد مع قاعدة بيانات AncestryDNA الهائلة. ونتيجة لذلك ، يمكن لمختبري AncestryDNA تلقي مطابقات الحمض النووي الأكثر موثوقية في أبحاث علم الأنساب.

جولي جرانكا

تعمل جولي عالمة في علم الوراثة السكانية في AncestryDNA منذ مايو 2013. قبل ذلك ، حصلت جولي على درجة الدكتوراه. في علم الأحياء و ماجستير حصلت على درجة الدكتوراه في الإحصاء من جامعة ستانفورد ، حيث درست البيانات الجينية من البشر وطورت أدوات حسابية للإجابة على أسئلة حول تاريخ السكان وتطورهم. كما أمضت وقتًا في جمع الحمض النووي ودراسته باستخدام أنابيب جمع البصاق مثل تلك الموجودة في مجموعة AncestryDNA. تحب جولي أن تقضي وقتها خارج الكمبيوتر في الاستمتاع بالهواء الطلق - المشي لمسافات طويلة وركوب الدراجات والجري والسباحة والتخييم والنزهات. ولكن إذا كانت في الداخل ، فإنها تخبز وترسم وترسم.

تعليقات

قضى الأخشاب على والدتي وابن عمي # 8217s الثالث. أنا & # 8217m لست مجنونًا بذلك. لم أجد العديد من مباريات ابن العم كما فعلت قبل Timber. أدرك أنني كنت أحصل على بعض النتائج الإيجابية الخاطئة ، لكن بعض المباريات الجيدة خسرت. هل ترغب في رؤية مرشح محسن.

لدي أخ غير شقيق تم العثور عليه حديثًا والذي قدم أيضًا الحمض النووي للأسلاف. كنت آمل أن يؤكد اختباري علاقتنا ، لكنه لم يكن كذلك. يبدو أن تيمبر يمكن أن يكون الجاني. هل يمكن التحقق من ذلك بطرق أخرى؟ ما مدى معصومة اختبار DNA Ancestry & # 8217s؟

حدد المصطلحات & # 8220rncentor السلف & # 8221 و & # 8220 السلف المشترك البعيد. & # 8221 بدون مناقشة معمقة ومراجعة البيانات الأساسية ، هذا المنشور يروج لقيمة AncestryDNA & # 8217s خوارزمية الأخشاب تظل غير مقنعة. كما نوقش في التعليق الأول ، تخلصت Timber شديدة العدوانية وأخطأت تصنيف العديد من عملاء AncestryDNA & # 8217 المطابقات ، مما أدى إلى ظهور سلبيات خاطئة وجعل المطابقات الأكثر ارتباطًا أكثر صعوبة في تحديد موقعها في قوائم المطابقات الخاصة بنا. يبدو أن الأخشاب تكافح من أجل تحديد الأجزاء التي تشير إلى سلف مشترك يمكن تتبعه وأيها مجرد قطع أثرية من أصل جغرافي حيوي مشترك. بينما يشتكي العملاء من وفرة السلبيات الكاذبة وتنبؤات علاقة الضربة أو الفشل ، تستمر AncestryDNA في اتخاذ نبرة تهنئة ذاتية. يمكن للعملاء تقدير محاولة AncestryDNA & # 8217s لتقليل التطابقات الإيجابية الخاطئة (وهي ظاهرة لم يكن يجب أن تكون موجودة في المقام الأول) ، فقد تجاوز الجهد هدفه بوضوح. وفي الوقت نفسه ، لا يزال على AncestryDNA تجهيز منتج علم الأنساب الجيني الخاص بهم بأدوات تحليلية أساسية (مطابقة بيانات مقطع الحمض النووي ومتصفح الكروموسوم) أو تقديم مستوى الشفافية المطلوب لإجراء علم أنساب الحمض النووي الصبغي الجسدي. هذا غير مقبول وغير أخلاقي وغير معقول. بالنظر إلى حالة AncestryDNA ، يجب على القيادة والعاملين في مجال العلوم في الشركة أن ينفقوا طاقة أقل وموارد أقل تصفيق لأنفسهم ، وبدلاً من ذلك ، إنتاج منتج يستحق السعر الحالي. الوضع الراهن لا يثير الإعجاب.

أنا & # 8217m سعيد لرؤية مناقشة حول Timber. ربما يمكنك إلقاء بعض الضوء على تجربتي. خضت مباراتين عند 18.9 سم ، وكانا يتطابقان أيضًا مع 18.9 سم. بعد Timbering ، بقي واحد فقط ، مباراة a & # 8220Good & # 8221. كان لديهم تقريبًا نفس نقاط البداية والتوقف & # 8211 إذا كان هناك أي شيء ، كانت المباراة التي اختفت أكبر قليلاً.

يبدو وكأنه ترقق انتقائي جدا.

سيكون من الرائع أن يختار العملاء تلقي الشرائح الأكبر التي تمت تصفيتها بواسطة الأخشاب & # 8211 قل تلك التي تزيد عن 15 سم.

كما ذكرت أن أحد أسباب وجود مناطق متطابقة بشكل شائع هو أصل عميق شائع ، فهل ستستغل AncestryDNA هذا النوع من التطابقات لمنتج محسن & # 8220ethnicity & # 8221؟ وفي اختبار Timber ، هل قمت بتقسيم 300000 فرد من مجموعة الاختبار الخاصة بك إلى مجموعات عرقية سائدة ، لمعرفة ما إذا كان هناك تحيز عند مقارنة اختبارين لأصول متشابهة في الغالب ، مقابل اختبارين لأصل متباين؟

إذا فهمتك بشكل صحيح ، فإن Timber يزيل الأجزاء القديمة من الحساب ، ولكن ليس من البيانات الأولية. لذلك لا يزالون يظهرون في حواجب Ancestry & # 8217s الكروموسوم & # 8230. اه انتظر.

قد تحتاج الأخشاب إلى بعض التغيير والتبديل ، حيث اختفت بعض المباريات الأصغر التي أجريتها ، والتي كانت تحتوي على أدلة داعمة جيدة عبر المسار الورقي ، في عملية التطهير الكبرى. ومع ذلك ، فأنا سعيد لأنه تم التعامل مع غالبية المباريات الزائفة.

بعض من أكثر التطابقات إثارة للاهتمام هو الشذوذ الإحصائي ، مثل أن ما يبدو أنه ابن عم ثالث أو رابع لديه توثيق تم فحصه جيدًا باعتباره السادس أو السابع (بافتراض دائمًا عدم وجود NPEs). لا يزال ضمن النطاقات التي أشار إليها Blaine Bettinger (على سبيل المثال) في مقال حديث.

بالطبع ، يمكنني إجراء المقارنة فقط على الأقارب الذين قاموا بتحميل بياناتهم إلى GEDmatch. لقد حان الوقت لـ AncestryDNA أن يعض الرصاصة ويعطينا بيانات المطابقة الفعلية. أعلم أن الإدارة تعتقد أن هذه مشكلة & # 8220privacy & # 8221 & # 8212 ولكن إذا قمت بالتسجيل في AncestryHealth ، فأنت نفسك تتخلى عن جميع بياناتك لمن تريد Ancestry تسليمها إلى شركة التأمين الصحي الخاصة بك ، وهي شركة أدوية. ، صاحب عمل محتمل. إذا كنت أرغب في مشاركة مباراة مع مشارك آخر في برنامج DNA ، فأنا أمتلك هذا الامتياز بالفعل ولكن Ancestry يجعل من الصعب جدًا القيام بذلك. الخلل هو مجرد خطأ واضح.

& # 8217m أسمع تقارير قصصية عن نسبة عالية جدًا من الحالات (30٪ زائد) حيث لا يوجد تطابق في الطفل في أي من الوالدين. يجب أن تكون هذه نتيجة إيجابية خاطئة لدى الطفل أو سلبية كاذبة لدى أحد الوالدين. أتساءل ما إذا كان السماح للمباريات الأكبر بالمرور (كما اقترح ديفيد نيجوس أعلاه) سيحل بعض هذه التناقضات.

لدي شجرة شاملة للغاية ، بحثها والداي بالطريقة القديمة في الكنائس وقاعات المدينة والمقابر. كنت أبحث عن بعض أبناء عمومة الخط غير المباشرين الذين كان لديّ أثر ورقي جيد عندما كان

لدي شجرة عائلة واسعة جدًا بالطريقة القديمة وكنت بصدد ربط بعض تطابقات الحمض النووي الخاصة بي مع بعض أسلافنا الخلفيين. كان لدي أثر ورقي جيد للشجرة وعادة ما كان الجد الذي كنت أقيده عندما اختفت مباريات الحمض النووي. إذا كنت ستتخذ هذه القرارات بشكل تعسفي نيابة عني على الأقل إثبات ذلك لي بالسماح لي بتحليل الكروموسومات. هذا الموقف من جانبك بأن العملاء والآلاف من علماء الأنساب الجيني لا يعرفون أي شيء بغيض بالنسبة لي.
لقد فقدت أسلافًا رئيسيين في بعض عمليات البحث التي أجريتها في العائلة ، تلك التي ربطت بين العديد من أبناء عمومة الحمض النووي. والأسوأ من ذلك ، هو أنك تعتقد أن العميل غبي بدرجة كافية ليتبع بشكل أعمى ما يسمى بدوائر الحمض النووي والأسلاف المتوقعين. قد يكونون من أسلاف شخص ما ولكني أؤكد لكم أن الشخص الذي ذهب إلى يوتا من ولاية مين ولا تزال عائلته موثقة في ولاية ماين هو سلف متوقع مثير للضحك بالنسبة لي. كل دوائر الحمض النووي التي تحصل عليها هي المزيد من أبناء العمومة ، فأنا لا أهتم كثيرًا بإضافة أبناء عمومة ثالثة ، تمت إزالتها 3 مرات ، على سبيل المثال ، إلى شجرة عائلتي الشخصية. يُرجى التوقف عن إصدار هذه التصريحات غير المدعومة على عملائك. بقدر ما أشعر بالقلق ، فإن ملفك الشخصي الخاطئ للغاية لواحد من أجدادي الثالث هو كارثي. عملت عائلتي بجد للحصول على معلومات دقيقة عن أسلافي والآن ستكون قصته خاطئة طالما قام الناس بنسخها على أشجارهم ، عار عليك لهذا الإجراء الذي يتعارض مع جميع قواعد ومبادئ الأنساب الثابتة ..

& # 8220 & # 8230 يمكن لمقدمي اختبار الحمض النووي الريبي تلقي مطابقات الحمض النووي الأكثر موثوقية في أبحاث علم الأنساب. & # 8221

يحتاج العملاء المهتمون بشدة بنتائج مطابقة الحمض النووي الأكثر موثوقية في أبحاث الأنساب إلى تنزيل ملف البيانات الخام الخاص بهم من AncestryDNA ونقل ملفهم إلى واحدة (أو كليهما) من الشركتين اللتين تقبلان ملفات AncestryDNA.

على الرغم من أنني على ثقة من أنه يقوم بعمل جيد في الحفاظ على الموارد الحسابية ، إلا أن Timber لا يبدو أنه أفضل نظام لاستبعاد المباريات غير المجدية والاحتفاظ بالمباريات المفيدة.

أعتقد أنك & # 8217re على المسار الصحيح ، آن تورنر (انظر التعليق أعلاه).

بالحديث عن نفسي ، أكون أكثر ثقة في نظام يقضي على 99٪ على الأقل من شرائح 5-6 سم ويحافظ على 99٪ على الأقل من المقاطع التي يبلغ حجمها 20 سم أو أكبر.

لدي الآن أكثر من 8000 مباراة في AncestryDNA. بعد أن درست أفضل التطابقات لدي بعناية شديدة ، أشك في أن غالبية الأجزاء التي تمثلها تلك المباريات الثمانية آلاف ذات صلة بسلف مشترك خلال آخر 6 أو 10 أجيال.

أنا & # 8217d بكل سرور أتاجر بمعظم التطابقات البالغ عددها 8000 تطابق لبعض تفاصيل المقطع المتطابقة وجميع الأجزاء التي يزيد حجمها عن 20 سم التي تمت تصفيتها.

خذها من الأشخاص الذين & # 8217 الذين وضعوا منتجك في خطواته ، جولي جرانكا ، هناك مساحة كبيرة للتحسين.

رد: & # 8220A في AncestryDNA ، نستخدم خوارزمية طورها فريق علمي يسمى Timber. تتمثل فكرتها الأساسية في أنه إذا ظهر أن لدى شخصين حمض نووي متطابق في مكان معين في الجينوم ، ولكن يبدو أنهما يمتلكان أيضًا حمضًا نوويًا متطابقًا مع آلاف الأشخاص الآخرين في ذلك المكان المحدد ، فمن المحتمل أن يكون الحمض النووي المشترك بين الشخصين موروثًا. من أسلاف أبعد (أو مجموعة أسلاف بعيدة). بمعنى آخر ، ربما لا يكون هذا الجزء مناسبًا لسلف مشترك خلال آخر 6 أو 10 أجيال. & # 8221

لقد قضى Timber على ثقة العديد من المباريات المؤكدة لتثليث المقطع أو خفضها. نعم ، ابن عمي EG (على سبيل المثال) ينحدر من أجدادي الرابع بأربع طرق مختلفة والعديد من الأشخاص يشاركوننا كل جزء من شرائحنا الأربعة ولكن عددًا كبيرًا من هؤلاء الأشخاص قد وثقوا أسلافهم إلى هؤلاء الأجداد! نعم ، هناك العديد ممن يتشاركون هذه الشرائح ولكن من المحتمل أن يكون ذلك بسبب الخصوبة / زواج الأقارب ، بدلاً من الأجزاء المشتركة التي تكون متطابقة فقط حسب الولاية.

التحيز السكاني في الأخشاب؟ & # 8230 حتى لو كان Timber صالحًا ومفيدًا للسكان الذين يمثلهم معظم المشاركين من Ancestry DNA .. فلن يكون للمشاركين ذوي التاريخ العرقي المختلف ، أو المنحدرين من مجموعة سكانية مختلفة (فكر في المهاجرين الجدد من بلد ما بدون تاريخ طويل من الهجرة إلى الولايات المتحدة). يمكن أن تكون الأجزاء المطابقة الشائعة في المجموعة السكانية المهيمنة والتي تمثل أسلافًا بعيدة ، ذات أهمية أنساب في مجموعة سكانية مختلفة. هذا التحيز العرقي أو السكاني بسبب استخدام الأخشاب يقترح أنه يجب تجنب الحمض النووي للأصل من قبل أولئك الذين ليسوا أعضاء في السكان المهيمنين.

لدي سؤال & # 8230 إذا كنت أشارك 1717 سمًا عبر 62 شريحة & # 8230 ما الذي سيجعلنا ذلك .. مرتفعون للغاية ومتوافقون في العائلة المقربة .. محيرًا للغاية.

لقد وجدت ابن عم لديه هذا: 595 سنتيمترًا مشتركًا عبر 32 مقطعًا من الحمض النووي. بلغة إنجليزية بسيطة ، ماذا يعني ذلك ؟؟

أنا & # 8217m أحاول العثور على أقارب بعيدين & # 8211 أقارب الأجداد الذين ما زالوا يعيشون في ويلز. هل هناك أي طريقة للتحقق من مباريات الأقارب من مكان معين مثل أولئك الذين يعيشون في المملكة المتحدة أو ويلز؟

عند مطابقة الحمض النووي الخاص بي مع الحمض النووي للأسلاف ، هل حصل Ancestry بالفعل على عينات الحمض النووي من & # 8220 أسلاف ، & # 8221 أو من أفراد الأسرة في DnaCircle؟ كيف حصل Ancestry على الحمض النووي للشخص الميت؟

هل تتم تصفية الأخشاب بواسطة Ancestry فقط أم يمكنني القيام بذلك بنفسي؟ إذا كان الأمر كذلك ، كيف أفعل ذلك؟ شكرا FM

& # 8217m وجه هذا التعليق إلى كاتب هذا المقال. في هذه الفقرة ، & # 8220 ، ما يُظهره هذا الرسم البياني بوضوح هو أنه عند محاولة تحديد مطابقات الحمض النووي التي تشترك في الحمض النووي من سلف مشترك حديث ، فإن هناك ما هو أكثر بكثير من أحجام مقاطع الحمض النووي المتطابقة. لا تُثبت الأجزاء المتطابقة الأطول بالضرورة أن هناك سلفًا مشتركًا بين شخصين مؤخرًا. أظهرت مطابقة الحمض النووي بين مئات الآلاف من الأشخاص أنه حتى الأجزاء المتطابقة الطويلة يمكن أن تشير إلى الأصل المشترك أو التاريخ السكاني المشترك أو السلف المشترك البعيد. & # 8221 في الجزء الذي يقول & # 8220 حتى الأجزاء المتطابقة الطويلة & # 8221 ، فعل تقصد & # 8220 حتى المقاطع القصيرة المتطابقة # 8221. أعتقد أن هذا ما كنت تحاول قوله.

الدقة متوقفة. تم الإبلاغ عن علاقات ابن عمي المعروفة والتي يمكن إثباتها بشكل غير دقيق. يؤكد التحقق المزدوج على gedmatch أن AncestryDNA قد حلق الكثير من cM & # 8217s في هذه المباريات. مستوى العلاقة في العديد من مبارياتي الآن أقل من اللازم. على سبيل المثال & # 8230a تم إدراج ابن العم الثالث المؤكد الآن في المرتبة الرابعة. نفس السيناريو يتكرر في المباريات الأخرى أيضًا.
الرجاء تزويد متصفح كروموسوم. إن الاضطرار إلى الاعتماد على النتائج المنحنية للخوارزمية المتغيرة باستمرار لـ Ancestry & # 8217s ليس علمًا جيدًا ولا يساعدني & # 8217t في إجراء علم الأنساب الجيني الموثوق به.

في علم الأنساب ، يجب فحص كل حقيقة للتأكد من دقتها. يعد متصفح الكروموسوم في DNA & # 8230a ضروريًا لتحليل دقيق. أنت تخبرنا بقبول نتائجك في ظاهرها. هذه ليست ممارسة جيدة.

يعمل الكثير منا حولك من خلال تشجيع مبارياتنا على gedmatch. لكن ، لا ينبغي أن نفعل ذلك & # 8217t. ومعظم الناس لا يضعون نتائجهم على gedmatch ، لذلك نحن نفتقد فرص تثليث المطابقات الحقيقية لأنك فزت & # 8217t تعطينا متصفح كروموسوم.

لن يعرف جوس جذور عائلتي و # 8217

لست سعيدًا بالطريقة التي يتعامل بها Timber مع المباريات متوسطة المدى الخاصة بي. لدي ابن عم & # 8220mystery & # 8221 يتطابق ، وفقًا لـ AncestryDNA ، يشارك حوالي 22 سم على كروموسوم واحد. أي واحد؟ لا أدري. فاز AncestryDNA & # 8217t يقول. اختبر والدها للتو وهو & # 8217s ليس مباراة لي! ومع ذلك ، فهو يتطابق مع أحد أبناء عمومتي الثالثة المعروفين. ابنة عمي الثالثة المعروفة & # 8217s ، اختبرت أيضًا في AncestryDNA & # 8211 أنها تطابقني ، ولكن ليس ابن عم الغموض ووالدها. لكن في & # 8220competition & # 8221 & # 8211 GEDMatch ، جعلنا جميعًا متطابقين بشكل جيد ومصطفين على الكروموسوم 12. افتقار نظامك & # 8217s للشفافية وعدم إخبار أعضائك بالكروموسومات التي نشاركها في الحمض النووي مع مبارياتنا. تغير. نريد الشفافية ومتصفح الكروموسوم.

اشترك في النقاش

نحن نقدر ملاحظاتك حقًا ، ونطلب منك أن تحترم المعلقين والمؤلفين الآخرين. قد يتم الإشراف على أي تعليقات مسيئة. للمساعدة في مشكلة معينة ، يرجى الاتصال بخدمة العملاء.


5 أكبر الاختلافات بين MyHeritage و AncestryDNA

رقم 1: حجم قاعدة بيانات الحمض النووي

AncestryDNA جمعت الحمض النووي من 15 مليون شخص. جمعت MyHeritage عينات من حوالي مليوني شخص.

لذلك إذا كنت تبحث عن شركة اختبار الحمض النووي الخاصة بك لمساعدتك في العثور على أقارب من خلال مطابقات الحمض النووي ، فإن هؤلاء الأقارب يكونون رياضيين من المرجح أن تكون في قاعدة بيانات AncestryDNA & rsquos.

رقم 2: حجم قاعدة بيانات الأنساب

تنص MyHeritage على أن لديهم حوالي 104 مليون مشترك وأكثر من عشرة مليارات سجل تاريخي. تتم مقارنة هذا بـ AncestryDNA & rsquos ثلاثة ملايين مشترك و 20 مليار سجل. لذا ، بغض النظر عن تطابقات الحمض النووي ، يمكن لكليهما أن يقدم لك الكثير عندما يتعلق الأمر بتاريخ عائلتك.

أنا & rsquod أراهن أنك & rsquod كن سعيدًا حقًا باقتراحات شجرة العائلة التي تحصل عليها و rsquod من أي من الشركتين. لكنني لم أقم بالاشتراك في أي من خدمات الأنساب الخاصة بهم ، لذلك يمكنني & rsquot أن أخبرك كيف يقارنون من وجهة نظر شخصية حول هذا المتغير.

رقم 3: عدد المناطق المدرجة في تقدير العرق

سيعطيك كل من MyHeritage و AncestryDNA تفصيلاً لأسلافك وأعراقهم. يخبرونك & rsquoll أين عاش هؤلاء الأجداد ، وما النسبة المئوية للوراثة التي يمثلها كل عرق.

ولكن هنا و rsquos الشيء: لقد قسم AncestryDNA العالم إلى أكثر من 500 منطقة مختلفة. من ناحية أخرى ، يقسم MyHeritage العالم إلى 42 منطقة جغرافية.

# 4: تكلفة الخدمات

يكلف اختبار AncestryDNA & rsquos DNA أكثر من تكلفة اختبار MyHeritage & rsquos. كما أن رسوم الاشتراك الشهرية لخدمة الأنساب AncestryDNA & rsquos أعلى من رسوم MyHeritage & rsquos. لذلك ، إذا كان المال عاملاً في اتخاذ القرار ، يعد MyHeritage ميسور التكلفة أكثر بكثير.

# 5: جوهر وخصائص التقارير

بينما تشترك تقارير النسب التي تتلقاها من AncestryDNA و MyHeritage في العديد من العناصر المشتركة ، إلا أن هناك اختلافات بينهما.

تقدم AncestryDNA ميزة تسمى ThruLines ، والتي تتبع أسلافك إلى عدد من أسلافك المحددين. تُظهر هذه الميزة كيف & rsquore مرتبطة بمطابقات الحمض النووي الخاصة بك (أي ، من خلالها سلالة عائلة معينة).

يحتوي MyHeritage DNA على بعض الأدوات الفريدة مثل متصفح الكروموسوم ، والمجموعات التلقائية ، وخريطة الأعراق ، بالإضافة إلى نظرة عامة مصورة لمطابقات الحمض النووي الخاصة بك، والذي أطلعك عليه في القسم التالي. بالنسبة لي ، يبدو تقرير MyHeritage DNA & rsquos أكثر جوهرية.


نتائج

يحتوي AncestryDNA حاليًا على 363 منطقة عرقية محتملة ويطابق الحمض النووي الخاص بك مع 3000 عينة مختلفة من جميع أنحاء هذه المناطق. ويقولون أيضًا إنهم سيحدثون دقة اختبارك لذلك "يمكنك توقع رؤية تحديثات إضافية مع تطور علم الحمض النووي". بمعنى آخر: كلما جمعوا المزيد من العينات ، أصبحت النتائج أكثر دقة وتفصيلاً.

ما يلي هو تقسيم النسبة المئوية وخريطة تفاعلية مشفرة بالألوان لكل منطقة من المناطق العرقية على الكرة الأرضية. على سبيل المثال ، يحتوي "غرب أوروبا" على فرنسا وألمانيا الحديثة. ولكن نظرًا لأن الغالبية العظمى من الأشخاص الذين أجروا اختبارات الحمض النووي هذه حتى الآن هم من أصل أوروبي ، فإن التقسيم الإقليمي أكثر تحديدًا لأوروبا منه لأفريقيا وآسيا والأمريكتين. سيستمر هذا الأمر حتى يقدم المزيد من الأشخاص من أصول غير أوروبية حمضهم النووي.

خريطة تفككي العرقي من AncestryDNA.

يمكنك أيضًا النقر فوق كل منطقة لرؤية النطاق العرقي للحمض النووي. هذه هي النسبة المئوية لمرات ظهور العرق في 40 مرة تطابق الحمض النووي الخاص بك مع العينات.

يشمل التقسيم أيضًا "مناطق منخفضة الثقة" ، وهي أي مناطق عرقية تقل عن 5 في المائة. على سبيل المثال ، كان لدي 26 في المائة لبريطانيا العظمى ولكن لدي منطقة منخفضة الثقة بنسبة 4 في المائة لأيرلندا / اسكتلندا / ويلز. لذا يمكنك القول إن أصولي من تلك المنطقة بنسبة 30٪.

جميع المناطق العرقية التي يغطيها حاليًا اختبار AncestryDNA.

كان هذا سهلاً بما يكفي لفهمه. لكن الشيء الوحيد الذي لا تختبره AncestryDNA هو الأم أو الأب ، الذي يقسم أسلافك الجيني بين والدتك وأبيك. من المهم ملاحظة أن الاختبارات على الأم أو الأب - المشتقة من mtDNA و yDNA ، على التوالي - توفر مزيدًا من المعلومات حول سلالتك التي تعود إلى ما قبل 10000 عام ، ولكنها تعتبر أقل دقة من اختبارات الصبغة الجسدية. مثل اختبار الصبغيات الجسدية ، كلما زادت البيانات التي يتعين على الاختبار مقارنتها ، زادت دقة الاختبار. في حالة عدم وجود اختبارات mtDNA و yDNA من خلال AncestryDNA ، يمكنك الحصول على صورة أوضح لتراثك إذا قام أحد والديك أو كلاهما بإجراء اختبار AncestryDNA أيضًا.

خدمة رئيسية أخرى من AncestryDNA هي مطابقتك مع الأقارب ، والتي يمكنك اختيار الانسحاب منها. تقدم لك واجهة الويب قائمة بالأشخاص الذين يتطابق معهم الحمض النووي الخاص بك وتقدير ما إذا كانوا أبناء عمومة أول أو ثاني أو ثالث أو حتى رابع. (لقد وجدت أفرادًا من العائلة أعرفهم في هذه القائمة ، لذلك ليس لدي أي سبب للشك في النتائج.) يمكنك بعد ذلك الاتصال بهم عبر خدمة المراسلة في Ancestry.com.

جاء عدد قليل من أفراد عائلتي في مباريات الحمض النووي الخاصة بي. (تم طمس تحديد المعلومات.)


ما تعلمته بالفعل عن عائلتي بعد تجربة 5 اختبارات لأسلاف الحمض النووي

مكتشف الأسرة أخبار العلوم جربت المراسل تينا هيسمان ساي العديد من شركات الاختبارات الجينية الاستهلاكية لمعرفة المزيد عن أسلافها.

شارك هذا:

تكثر الإعلانات التجارية لخدمات اختبار الحمض النووي التي ستساعدك على معرفة من أين أتى أسلافك أو تواصلك مع الأقارب. لقد كنت مهتمًا بتاريخ عائلتي لفترة طويلة. كنت أعرف أساسًا مكان جذورنا: الجزر البريطانية وألمانيا والمجر. لكن الإعلانات دفعتني إلى التعمق أكثر.

Previous experience taught me that different genetic testing companies can yield different results (SN: 5/26/18, p. 28). And I knew that a company can match people only to relatives in its customer base, so if I wanted to find as many relatives as possible, I would need to use multiple companies. I sent my DNA to Living DNA, Family Tree DNA, 23andMe and AncestryDNA. I also bought the National Geographic Geno 2.0 app through the company Helix. Helix read, or sequenced, my DNA, then sent the data to National Geographic to analyze.

Genetic testing goes mainstream

This story is part of a series on consumer genetic testing. See the whole series.

These companies analyze hundreds of thousands of natural DNA spelling variations called single nucleotide polymorphisms, or SNPs. To estimate ethnic makeup, a company compares your overall SNP pattern with those of people from around the world. SNP matches also help companies see who in their database you’re related to.

Some of the companies also analyze a person’s Y chromosome or mitochondrial DNA. Y chromosome DNA traces a man’s paternal line. In contrast, mitochondrial DNA traces maternal heritage, since people inherit mitochondria, which generate energy for cells, only from their mothers. Neither type of DNA changes that much over time, so those tests usually can’t tell you much about recent ancestors.

Once I sent in DNA samples, my Web-based results arrived in just a few weeks. But my user experience, and results, were quite different for each company.

National Geographic Geno 2.0

MOTHERLINE National Geographic Geno 2.0 shows how a customer’s maternal line migrated and changed across time, as determined by analyses of mitochondrial DNA. A heat map indicates where members of your maternal line are most prevalent. National Geographic Geno 2.0

At $199.95, National Geographic’s test is the most expensive, yet the least useful. The results are generic, and the ethnicity categories are overly broad. My results say that 45 percent of my heritage came from people living in southwestern Europe 500 to 10,000 years ago. That doesn’t tell me much and doesn’t reflect what I know of my family history.

There’s no relative matching, though Geno 2.0 shows which historical “geniuses” may have shared your mitochondrial or Y chromosome DNA. I don’t know how National Geographic knows about the mitochondria of Petrarch, Copernicus or Abraham Lincoln. So I’m skeptical that I am actually related to those famous figures, even from the distance of 65,000 years, the last time we supposedly had an ancestor in common. The service also calculated the percentage of Neandertal ancestry that I carry. I take geeky pride that 1.5 percent of my DNA comes from Neandertals, topping the 1.3 percent average for Geno 2.0 customers.

Overall, Geno 2.0 has a nice presentation, but I learned more about my family history elsewhere. Since I bought the Geno 2.0 kit as an app through Helix, I don’t know if the kit purchased directly from National Geographic, which is processed by Family Tree DNA, would yield different results.

Living DNA

ENGLISH ANCESTRY Living DNA offers fine-scale ethnicity estimates for people of British or Irish descent (Saey’s results shown). The company is less certain about subregional estimates than it is about global estimates. Living DNA

Another expensive test ($159) came from Living DNA. When I saw the company’s ad claiming to pinpoint exactly where in the British Isles a person’s genetic roots stem from, I decided to give it a go. The company highlights ethnicity on a world map, then lets you zoom in from the continent level. I found that 22.5 percent of my heritage came from Lincolnshire in east-central England. I haven’t yet traced any ancestors to Lincolnshire, but I did find through much genealogical sleuthing that one of my sixth-great-grandfathers came from Aberdeen, Scotland. Living DNA says that 3.1 percent of my DNA is from Aberdeenshire. Written narratives on the website provide a history of each reported region.

Using mitochondrial DNA and, if applicable, Y chromosome DNA, the company can trace your maternal and paternal lines back to human origins in Africa and show where and when your particular line probably branched off the original. My “motherline” probably arose in the Near East 19,000 to 26,000 years ago, Living DNA claims, and my ancestors were some of the first people to enter Europe. In February, the company announced that it would soon launch a relative-matching service for its customers.

I’m not sure the service would be worth the price tag for people whose ancestry doesn’t contain a strong British or Irish tilt, though Living DNA says it is working to improve ethnicity estimates in Germany and elsewhere.

Family Tree DNA

ANCIENT DNA MATCHES Family Tree DNA is the only company Saey tried that compares customers’ DNA with that of ancient modern humans. But based on the results’ presentation, it wasn’t clear whether Saey actually shares DNA with the ancient people indicated on the map (shown). Family Tree DNA

The most no-frills of the bunch is Family Tree DNA. For $79, “autosomal” testing looks for genetic variants on all of the chromosomes except the X and Y sex chromosomes. Y chromosome and mitochondrial DNA analysis costs extra.

Family Tree DNA allows a user to build a family tree, incorporating personal DNA tests and matches from the site’s relative-matching section. I found more than 2,400 potential relatives. A chromosome viewer lets me see exactly which bit of DNA I have in common with any particular relative, or with up to five relatives at a time. That feature also allows users to trace how they inherited DNA from a shared ancestor. But I found this tool difficult to use.

The website offers little explanation of results. For instance, I was excited to see that my DNA was compared with that of ancient Europeans, including Ötzi the Iceman, who lived 5,300 years ago (SN: 9/17/16, p. 9). Family Tree DNA is the only company I tried that incorporates ancient DNA into its results and that feature was what convinced me try this company. I did get a breakdown of how different groups — Stone Age hunter-gatherers, early farmers and “Metal Age Invaders” from the Eurasian steppes — contributed to my DNA. But when I saw Ötzi’s dot on my ancestry map, it wasn’t clear if that meant we share DNA or if the map was merely showing where he lived.

23andMe

MELTING POT 23andMe color-codes parts of chromosomes according to the ethnic group that contributed the DNA. For instance, Saey inherited from her dad a bit of DNA on chromosome 15 that carries western Asian and northern African heritage (purple). 23andMe

23andMe ($99) offers one of the more complete packages of information. Most companies show a map of ethnic heritage. 23andMe does, too, but also presents an interactive diagram of all of a person’s chromosomes, indicating which portions carry a particular ethnic ancestry. Because my parents also did 23andMe, I learned that my dad handed me a tiny bit of chromosome 15 that carries western Asian and northern African heritage. My mom gave me the 0.3 percent of my DNA that comes from the Balkans, in a single chunk on chromosome 7, which makes sense since her grandparents came from Hungary. Playing with the chromosomes is fun. But I question the accuracy of these results (see my related article for more on why ancestry tests may miss the mark).

23andMe presents Neandertal heritage in terms of the number of genetic variants you carry. A family-and-friends scoreboard shows where you stack up. (I top my leaderboard with 296 Neandertal variants, more than what 80 percent of 23andMe customers have.) The report also explains what some of those Neandertal variants do, including ones linked to back hair, straight hair, height and whether you’re likely to sneeze after eating dark chocolate. The company doesn’t test for all possible Neandertal variants, including ones that have been linked to health (SN Online: 10/10/17 SN: 3/5/16, p. 18).

Like Geno 2.0, 23andMe uses mitochondrial and Y chromosome DNA to trace the migration patterns of a person’s ancestors, from Africa to the present day.

Relative matching is both interesting and frustrating. I could see the people I match, how we might be related and compare our chromosomes. But 23andMe doesn’t provide a way to build family trees to further explore these relationships.

AncestryDNA

OLD AND NEW ROOTS AncestryDNA shows ethnic groups in the Old World that contribute to your history. For some people, the map (orange blob) may indicate your ancestors settled in the United States early in American history. AncestryDNA

AncestryDNA ($99) doesn’t give the variety of information other companies do. But it has useful genealogical tools, provided you link your results to a family tree that you can build with help from historical records via a paid subscription to Ancestry.com.

One interesting feature of my heritage report was that it went beyond spots on the map in Europe to also show a region of the United States called “Northeastern States Settlers.” A match to that category tells me that my ancestors who came from Europe probably initially settled in New England or around the Great Lakes. They did. One branch of my family tree set roots in Massachusetts in the 1640s. Using birth, death and immigrant records from Ancestry.com, I could build a timeline to show when and from where individual ancestors immigrated to the United States.

AncestryDNA also matches you with relatives, but you can only see how you’re related to those people if they have also chosen to make family trees.

A feature unique to AncestryDNA is called DNA circles. It shows connections between individuals and family groups who share DNA with you. These circles also contain descendants of your ancestors who you don’t directly share DNA with. Therefore, this feature allows you to extend relative matches beyond what traditional DNA matching can do.

For instance, I am in a family group with my uncle and a cousin. We all share DNA with 24 other descendants of Samuel Pickerill, a drummer during the Revolutionary War. Pickerill has 42 other descendants with whom my family group doesn’t share DNA. Those 42 Pickerill descendants happened to inherit different bits of DNA from Pickerill than my uncle, his cousin and I did. That sometimes happens because of the random nature of the rules of biology and genetics (for more on those rules, check out this video).

Genealogy junkie

Although I’ve always been interested in family history, DNA testing has gotten me hooked on genealogy research.

23andMe and AncestryDNA were the most fun to use. 23andMe can tell me whether a relative is on my mother’s or father’s side of the family. But then I have to go back to AncestryDNA and comb through my family tree to learn how we’re really connected. DNA can kick-start a genealogy hunt, but combing through marriage certificates, military rolls, census records, immigration documents, old photographs and other records — which Ancestry.com can provide — is what really tells me who my ancestors were.

All in the family

A variety of consumer genetic testing companies offer ancestry testing. Here’s how five such services compare.

Geno 2.0 Living DNA Family Tree DNA 23andMe AncestryDNA
كلفة $199.95 $159 $79* $99 $99
Services include:
Ethnicity estimates
Relative matching Coming soon
Neandertal results
Y chromosome analysis
Mitochondrial DNA analysis
Family tree building

*Y chromosome and mitochondrial DNA analysis costs extra

Questions or comments on this article? E-mail us at [email protected]

A version of this article appears in the June 23, 2018 issue of Science News.


Manual Input Programs

If downloading the DNA match information is not possible via an online 3 rd party tool, there are some programs that will help you analyze the data fairly quickly. These involve manually entering DNA match data. In May of this year, AncestryDNA restricted third-party analysis tools from using its database. These important workaround programs were developed and allow an alternative method of gathering DNA match data for analysis.

AutoFastCluster for LivingDNA and Ancestry

This program is called AutoFastCluster because it can return the results of manually entered DNA data in a few seconds, rather than hours or the next day that it typically takes to generate Genetic Affairs AutoClusters. To use the program, manually enter the DNA match names, the amount of shared DNA in centiMorgans (cM), and any notes.

You can choose the maximum and minimum amount of shared DNA you want to be analyzed. You can export the matches and shared matches in a .csv file or Excel file for use in other DNA analysis programs such as DNA Painter.

Shared Clustering by Jonathan Brecher

Shared Clustering is another useful Open Source program for clustering your DNA matches at the beginning of a research project. Jonathan Brecher created an Excel template that holds DNA information use to cluster DNA matches. It doesn’t matter which DNA company the data comes from, but you need to enter the information by hand. You can extract the names and amount of shared DNA from a downloaded .csv file generated by a DNA testing company and paste that information in the template that Jonathan Brecher has created. You can read more about this method here and here.

Shared Clustering image used with permission from Jonathan Brecher

Try using one or more of these methods the next time you start a new genetic genealogy project. Making sense of the data will make your research will not only go faster, but you’ll also be researching like a pro with DNA!

شارك هذا:

مثله:

متعلق ب

About Robin Wirthlin

Robin Wirthlin has a B.S. in Molecular Biology from BYU and a Certificate in Genealogical Research from Boston University. Robin loves to use genetic genealogy to solve family history mysteries and break through “brick walls.”

4 Comments

Leave your reply.

Excellent overview. To add, the described methods are all using shared match data which is the easiest way to perform clustering. Another method is by using overlapping DNA segments. The new AutoSegment tool (https://www.geneticaffairs.com/features-autosegment.html) allows for clustering using overlapping segments for data from MyHeritage (!), 23andme, FTDNA and GEDmatch. The latter also employs triangulated data, improving the quality of the clusters even more. And last but not least, AutoSegment employs local files so it doesn’t require the website credentials.

/>Robin Wirthlin

شكرا لك! That means a lot coming from you! I am a big fan of Genetic Affairs, the AutoCluster tools you offer have helped me and helped so many others quickly separate DNA matches and discern how the DNA matches are related to each other. I’m looking forward to using the new AutoSegment Tool. It’s amazing how many tools have been developed in the last 2 years that help us discover new relatives and ancestors. Thank you for sharing your skills and talents with all of us!


Salary Range for Forensic DNA Analysts

DNA analyst salaries can vary quite a bit based on several different factors. The Bureau of Labor Statistics (BLS May 2020) reported that the median salary for forensic science techs, including DNA analysts, was $60,590. In the same year, the average annual salary was $63,170 for the 16,520 techs employed nationally (BLS May 2020).

Here are the average annual salary percentiles for forensic science technicians in the U.S. (BLS May 2020):

  • 10th percentile: $36,630
  • 25th percentile: $46,460
  • 50th percentile: $60,590
  • 75th percentile: $79,330
  • 90th percentile: $100,910

Factors that could affect salaries available to DNA analysts include location, the type of work that one is doing, and the department for which one works. The number of years on the job and types of degrees and advanced certificates held could be other factors.


Best DNA Raw Data: 23andMe, AncestryDNA, FamilyTreeDNA or MyHeritage?

* The above link is an affiliate link. Save $10 at Nebula Genomics with 10OFF until 5/31 and support our efforts.

The Difference Between Genotyping and Whole Genome Sequencing

In this article, we are comparing genotyping companies. If you want the latest and greatest technology, Genetic Genie recommends getting Whole Genome Sequencing. Whole Genome Sequencing allows consumers to get clinical-grade information about all the variants in their genome.

23andMe, AncestryDNA, MyHeritage and 23andMe do not currently offer Whole Genome Sequencing tests. Instead, they use genotyping arrays that give you around 0.02% of your DNA. Data scientists try their best pick the most important variants, but a lot of important and/or currently unclassified health-related variants will be completely missing from raw DNA data files. And a lot of health-related variants (especially insertion/deletion variants like BRCA) are often not correctly called by these genotyping arrays. So when using third-party tools to analyze your raw data, you have to be aware of these limitations. Errors in interpretation aren’t necessarily the fault of third-parties. If third-parties don’t filter out every miscall from these genotyping arrays (which is very hard), you may end up with some erroneous information.

While genotyping had its limitations, these tests are generally more useful than Whole Genome Sequencing for general ancestry purposes. However if you are male, technical, and are into Genetic Geneology, you can use a service like YFull for a very advanced analysis of your Y-DNA from Whole Genome Sequencing data.

Raw Data SNP Comparison

Chip versions are included for the Total SNPs. Other information is based on the latest chip versions when this article was published. This table describes the basic raw data offerings without add-on tests.

(table scrollable on mobile device)

SNP data computed internally by Genetic Genie. ClinVar data based on 5/7/2020 release.

23andMe has several versions of their chips. Each chip has a different number of SNPs (Single Nuceleotide Polymorphisms). 23andMe’s V2 chip from 2009 has about 555,000 SNPs, the v3 chip from 2010 has about 900,000 SNPs, the v4 chip from 2013 has about 570,000 SNPs, and their current v5 chip (2017 to present) has about 640,000 SNPs. AncestryDNA has about 700,000 SNPs on their v1 chip and about 664,000 on their current v2 chip. MyHeritage’s autsosomal v1 chip has about 708,000 variants and their v2 chip has about 720,000 SNPs. FamilyTreeDNA (FTDNA) has about 702,000 SNPs. However, FTDNA doesn’t come with Y-DNA or mtDNA and adding a full mtDNA sequence or extra Y-DNA information can be costly. However, you can upload your full mtDNA sequence FASTA file to third parties like MITOMASTER for haplogroup prediction.

In terms of clinical SNPs, 23andMe currently has approximately 33,000 SNPs in ClinVar in their v5 chip, FamilyTreeDNA (FTDNA) has about 19,000 ClinVar SNPs, My Heritage DNA has around 20,000 ClinVar SNPs and AncestryDNA has more than twice as many ClinVar SNPs at around 76,000.

Clinically-relevant SNPs may not be a huge deal if your primary interest is in ancestry. But if you want to take a peek at health related variants with third party apps, it’s important to know what’s in the product you are getting.

FTDNA and MyHeritage DNA are tied for the most autosmal SNPS at about 702,430. In terms of other non-autosomal SNPs, AncestryDNA has the most X SNPs at around 24,887. 23andMe has the most mtDNA SNPs at 4,301.

Getting more SNPs with merging and imputation

To merge files, you can use the Raw Merger option in the Windows Application DNA Kit Studio. Of course, there are countless technical ways to accomplish this on the Linux and Mac command line, but this article is designed to be newbie friendly. You can merge multiple AncestryDNA files, multiple 23andMe files, a mix of 23andMe and AncestryDNA files, etc. If you’ve been tested multiple times on multiple chips, merging files will give you a lot more SNPs in a single raw DNA data file.

Combined files can be useful for both health analysis and genetic genealogy. Combining kits can also increase accuracy in your match information when using the online service GEDmatch.

We’re not going to get into what imputation is or how it works in this article, but imputation is an easy (and magical) way to get some extra SNPs. You can upload your 23andMe formatted file Michigan Imputation Server to get more variants.

This process is fairly accurate but is also error-prone. This is probably fine for ancestry purposes but should not be trusted if you are looking at health variants. It still may be fun to get a few more health related variants out of curiosity, but I definitely wouldn’t put any faith into such data if you are planning to use imputed data for health analysis.

The Winner is AncestryDNA

We find AncestryDNA to be the best DNA raw data test kit for both ancestry and health. Not only does 23andMe have significantly less health variants than AncestryDNA, but many variants have custom proprietary identifiers (often important insertion/deletion indel variants) that are miscalled. With some effort, these proprietary variant identifiers can be 100% successfully decoded into their non-proprietary forms, but why did they bother? But 23andMe does deserve some credit as they provide the most Y SNPs and mtDNA variants in their raw data file. 23andMe provides raw data at an affordable price that is well-rounded for genetic geneoological purposes, especially if mtDNA data and Y SNPs are important to you.

AncestryDNA is not perfect either. It has plenty of miscalls for health-related variants. But it is still the best and provides well-rounded consumer genotyping data for both ancestry and health. However, 23andMe is significantly better for mitochondrial DNA analysis and has a lot more Y SNPs, so combining raw data from 23andMe and AncestryDNA using DNA Kit Studio may be the best bargain.

FamlyTreeDNA (FTDNA) is trusted by amateur and professional genealogists but is not good for health analysis. If genealogy is your thing, you might want to consider FamilyTreeDNA. FamilyTreeDNA can do add-on tests such as sequencing of the Y chromosome and mitochondrial DNA. You can receive your full mtDNA in FASTA format and your Y Sequencing in BAM format for upload to services like Y Full. However, it’s pricey: Currently $159 for your mtDNA sequence and $449 for the Big Y-700. These add-ons are not standard genotyping and therefore are separate from their DNA raw data genotyping file. At this point at time it’s more affordable to get a Whole Genome Sequence (WGS) test and extract your Y DNA and mtDNA yourself. This takes a little bit of technical skill and plenty of hard drive space, but we think it’s worth it.

If you prefer FamilyTreeDNA’s data for your uses but want a good amount of X SNPs and a few Y SNPs, MyHeritage DNA may be the best choice. Like FTDNA, MyHeritage DNA’s data is good for ancestry use but not health analysis. However, MyHeritage DNA does not have add-ons for a full mtDNA sequence or Y chromosome sequencing.

There is no one-size-fits-all recommendation for everyone, but we think AncestryDNA’s raw data is best choice for the majority of people — especially if one has an interest in both ancestry and health.

The best DNA raw data genotyping tests in order from best to worst are:

  1. AncestryDNA (Starting at $99)
  2. 23andMe (Starting at $99)
  3. FamilyTreeDNA (FTDNA) (Starting at $79)
  4. MyHeritage DNA ($79)

AncestryDNA is the best genotyping raw data for uploading to health raw data interpretation/analysis services such as Genetic Genie, GenVue Discovery, Promethease, StrateGene and Xcode Life, and others. With 637,469 autosomal SNPs, AncestryDNA raw data is also a good option for services like GEDmatch and DNA.Land.

Whole Genome Sequencing (WGS) Is Better and Is the Future

If you want data with accuracy and very few miscalls, check out companies like Nebula Genomics or Dante Labs. I’ve done Whole Genome Sequencing through Dante Labs myself, but I’m inclined to say that Nebula has a better science team and is more reputable.

Nebula Genomics has in-depth Whole Genome Sequencing ancestry tools. They can look at your Y-DNA, your mtDNA and have formed a partnership with Family Tree DNA (FTDNA) so you can access the world’s largest Y-DNA and mtDNA databases. It’s a couple hundred extra bucks, but I think it’s worth the investment. I’ve sent in my Nebula kit and am waiting for results.

The data I have received from Dante Labs was very good, but their customer service is par at best. Dante is more focused on health-related variants, but customers have reported errors in their reports. Dante has been trying (they even created their own sequencing center), but they have struggled with customer service, timeliness (though they have a much faster turnaround since they built their own sequencing center), and getting the data right.


Download Your AncestryDNA Matches in 10 Minutes!

UPDATE: AncestryDNA has issued a cease and desist order, and this process is no longer available to download your Matches. اسف بشأن ذلك.

هذا هو تحميل: all your Matches, a hyperlink [to their Page as a Match to you], Shared cM, Shared Segments, Tree Type, Tree Size, Common Ancestors [per ThruLines], a tic for each Dot and Star, and your Notes! This fast download does NOT include your Shared Matches, which may take days to download.

  1. Before running this program, I set up a separate folder with todays date [e.g. 20200409] for each download the Shared Clustering program will give you a chance to select this folder and to rename the download file.
  2. Download the Shared Clustering program. See my review of this program here. The link to upload this program is: https://github.com/jonathanbrecher/sharedclustering/wiki
  3. Click on Download TAB
  4. Enter your Ancestry user name and password [stored on your PC only]
  5. Click on Sign In
  6. Select your Test (if you have access to more than one)
  7. Click the button for Fast but incomplete
  8. Open Advanced options
  9. Lowest centimorgans to retrieve: 6 [this includes all of your Matches]
  10. Lowest centimorgans of shared matches: 4000 [this means don’t download any Shared Matches]
  11. Click on: Get DNA Matches

Here’s a picture of the message when the download is complete:

So 125,000+ Matches in 6 minutes – your results may vary.

After the download, Export the downloaded txt file to Excel. Click on the Export TAB, and follow the prompts to create an Excel file – takes about 4 min.

You can then use/manipulate the Excel file. You can sort on any field, and you can edit any Notes and then Upload those revisions back to AncestryDNA. I use this as an opportunity to do a Quality check of my Notes, and to insure I have a Note for each Match with a ThruLines Common Ancestor. I find it’s much easier to edit Notes in the spreadsheet, than to jump around to each Match at AncestryDNA. NB: Don’t edit Notes in AncestryDNA when you are also editing Notes in the spreadsheet. If you do any edits in AncestryDNA, you need to do a new Download (it only takes 10 minutes!)